Biocombustibilii nu sunt deocamdata competitivi si nici intotdeauna ecologici, iar productia este limitata din cauza problemelor legate de disponibilitatea biomasei. Mai mult, politica Executivului de la Bruxelles privind acesti combustibili sufera de o lipsa de viziune pe termen lung. Desi s-au cheltuit nu mai putin de 430 de milioane de euro, in principal, pentru cercetarea in domeniu, introducerea pe piata a biocombustibililor de generatii noi este mai lenta decat se preconiza. Biocombustibilii concureaza pentru materii prime cu alte sectoare, in special cu agricultura, nu sunt viabili economic, iar efectele benefice ale folosirii sale pentru mediu sunt  supraestimate. Acestea sunt cateva dintre principalele concluzii ale unui raport al Curtii Europene de Conturi, in care se mai atrage atentia ca directia in care se indreapta biocombustibilii este neclara si exista dificultati la fiecare pas.